亨利·戈尔丁饰演一名因背负了复杂过去而隐忍的独行者，代号蛇眼。一次偶然，他救下了岚影一族的准接班人，从而被约请参与他们在日本的组织。在那里，岚影一族不但教会了蛇眼如何成为一名忍者，也给了他不时想要的一个家。但当蛇眼过去的秘密被逐渐揭开，他的信誉以及对组织的忠实也将遭到考验，即使这会使他会失掉最亲近的人的信任。特种部队原著中的经典角色也将在《特种部队：蛇眼来源》中逐一亮相。